Met de opties voor batchexport kunt u het formaat en de map specificeren waarnaar moet worden geëxporteerd, evenals de extensie die moet worden gebruikt. Elk bestand krijgt een naam volgens de kolom Naam in Geneious. Exportmap: Om een hele map naar een enkel bestand te exporteren, klikt u op de map in het Bronnenpaneel en gaat u naar Bestand → Exporteren → Exportmap.